作为深化新三板改革的重要举措，设立北京证券交易所必然会全面提升新三板服务中小企业的能力。据介绍，北京证券交易所将牢牢坚持服务创新型中小企业的市场定位，尊重创新型中小企业发展规律和成长阶段，提升制度包容性和精准性。这不仅意味着新三板精选层法律地位的提升，更将有效提升市场效率、激活市场活力，引导资源更多关注优质中小企业，提高品牌效应和吸引力，引领中小企业群体更好发展。
设立北京证券交易所，形成北京证券交易所与沪深交易所、区域性股权市场错位发展和互联互通的格局，中国资本市场的多层次市场结构将进一步完善，中国资本市场将更有活力和韧性。北京证券交易所上市公司将由创新层公司产生，维持新三板基础层、创新层与北京证券交易所“层层递进”的市场结构。从制度设计出发，北京证券交易所未来的市场运行、投资者结构、主要基础制度安排等都有着显著的中小企业特色，与沪深交易所差异明显。
对于北交所的设立，主要影响有：
2、释放出资本市场深化改革的积极信号，2019年以来，围绕资本市场高质量发展，开启了融资端和投资端改革，融资端改革包括注册制试点、科创板设立、再融资新规等，此次北交所设立，是又一里程碑事件，而投资端改革启动了支持中长期资金入市等政策，但总体上还有很多内容可以期待，如基金通、开户通、T+0、衍生品扩容等；
3、资本市场重大扩容给上市服务企业带来更多的业务机会，包括投行业务、一级市场投资业务、经纪业务、两融业务等。
可以预期，随着改革的稳步推进，新三板将形成一个服务中小企业更加专业化的平台，让越来越多的中小企业、“专精特新”企业得到多层次资本市场的助力，迎来更高质量的发展。